飲食成分是影響腸道屏障功能的另一因素。全腸外營養（TNP）可增加腸黏膜通透性和細菌轉位，即使使用不同脂質配方的飲食也可增加腸細菌轉位。饑餓時可增加細菌轉位的發生。有人認為，慢性營養不良一般不會導致腸黏膜屏障功能不全。但此時如再有另外一刺激如炎癥或注射內毒素等就可使細菌轉位增加。關于TNP及基本要素飲食增加腸黏膜通透性的機制仍不清楚，但近年的研究認為，該機制涉及腸黏膜屏障本身及腸相關免疫功能。Deitch等研究表明，TNP及基本要素飲食可增加上皮對水溶性物質及活菌的通透性。同時也可誘導腸免疫功能及細胞的改變，減少腸上皮內及Peyer結節內的淋巴細胞、IgA+漿細胞及IgA的產生等。

正常飲食中的纖維素可能對腸屏障功能的維持具有重要意義。如在飲食中添加纖維素可預防TNP及要素飲食所誘發的腸通透性增加及細菌轉位的發生。發泡劑是一種纖維素，也可明顯改善腸屏障功能。關于其機制尚不清楚。纖維素可能為常駐菌的食物，在維持腸道微生態平衡中有意義。

谷氨酰氨對腸道屏障功能的維持也很重要。研究認為，腸內或腸外營養中增加谷氨酰氨可減輕腸屏障功能的損害，可改善腸免疫功能。此外，許多腸營養激素和生長激素對腸屏障功能的作用也很重要，主要有胰島素樣生長激素、表皮生長因子、Bombesin，肝素、纖維母細胞生長因子等。也有報道稱前列腺素E也可改善腸屏障功能。